天山马鹿体型较大，成年公鹿体高130～140厘米，体长130～150厘米，体重240～330千克。母鹿体高115～130厘米，体长120～140厘米，体重160～200千克。天山马鹿体粗壮，头大额宽，四肢强健。夏毛呈深灰色，臀斑呈棱状，白色或浅黄色。冬毛呈浅灰褐色，颈部有长而粗密的俄毛和髯毛，头、颈和四肢的被毛呈深灰色，眼圈呈浅黄色。茸毛呈灰黑色或灰白色。天山马鹿成角多为7～8个杈，茸角的主干寸眉枝、嘴头粗长，常见到一些铲形或掌状的四权茸。
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